《可可夜總會》故事描述墨西哥的鞋匠家族「裡韋拉斯」有個代代相傳的家訓，就是家族的成員絕不能與音樂有任何關係，但天生音樂魂的男孩米高難以抵擋音樂的魅力，時常躲在家中閣樓練習，更無師自通了一身不得了的吉他技巧。就在「亡靈節」這天，父親發現了充滿樂譜的祕密閣樓，盛怒之下砸了他的吉他，傷心又憤怒的米高跑去已逝偶像吉他之神的紀念碑內，卻意外進入「夜總會」的世界，米高變成了只能被亡靈看見的「活死人」。

米高必須在亡靈節結束前找到在夜總會的祖先家人，才能回到活人的世界。他是否能在夜總會的世界釐清家族對音樂的怨念，並在亡靈節結束找到回家的路呢？